1年経ったところで別のインター校に転校したということであれば問題ないでしょう。
ただ、念の為受験を予定している大学には直接聞いてみることをお勧めします。大学学部によっては異なる基準を置いている可能性もあるからです。

高校3年生ということですが、現在日本の高校に在籍しており、海外の学校を卒業していないということであれば、帰国枠で受験できる大学は少なくなってきますので、注意が必要です。
Update: '20年1月21日
2018年6月にいただいたご質問への回答

帰国生というのは海外の学校に在籍していた生徒を指す概念です。ただし、AO入試や海外就学経験者入試など、大学側はなんとか優秀な生徒を獲得するべく様々な入試制度を編み出し、英語の得意な生徒に門戸を開いています。

端的に申し上げますと、国内インターに高２で編入した場合、上智や早稲田の国際教養学部などの受験資格は持てますが、帰国枠受験については、半数ほどの大学が受験できないと思って下さい。それでも半数くらいは受験可能であるのは、高２で編入ということで、帰国後2年以内という要件にあたる可能性があるからです。大学がその国内インターを卒業要件にあたるとみなして、さらに帰国後2年以内であることで資格を満たすと判断すれば受験できます。ただし、慶應や東大などの要件が厳しい大学の受験はできないと考えてよいです。

国内の普通科の高校に編入しても同じようなことは言えます。この場合、一般入試の受験資格は得られますが、現実的に高２で戻ってきて一般受験をするといのは厳しい状況だと思われますので、事実上インターに編入したのと同じような状況であると言えます。国内高校の場合は、国内インターよりはAO・推薦の選択の幅は広くなるかもしれません。

Update: '19年7月8日
2018年2月にいただいたご質問への回答

小中を合わせて通算の滞在を要件として掲げている大学や高校継続1年以上の大学であれば受験可能ですが、数は限られて来るのが実情です。

英語を得意とし、それを活かすような学部を選ぶつもりであれば、帰国枠ではなくAOでの出願がたくさんあるので、1年間であっても海外の学校に進むことは悪くないと思います。

帰国枠に限定して考えるのであれば、学年を落として2年間の滞在を考えるか、大学の選択肢を狭めて考えるかのどちらかになると思います。

Update: '19年5月15日
2018年1月にいただいたご質問への回答

ただし、早稲田や慶應といった人気の私大や国立では、海外の学校を卒業していないと帰国枠が使えないことが多いです。これも学部によるので、一概には言えませんが、概略の理解としては、早慶国立、また理系学部では、上記条件では帰国枠が適用されないと考えておいてください。
AO入試まで広げれば、受験できる大学はたくさんありますので、そちらも視野に入れることもできます。

現地インターナショナルスクールでは、英語力の向上、特にTOEFLなどの資格で高得点を取ることを目標にするのがよいと思います。

Update: '19年1月21日
2017年2月にいただいたご質問への回答

また、二年間留学した場合は帰国枠が使えますが、京都大学工学部、名古屋大は帰国枠入試を行っていません。
したがって、志望校としてお書きいただいた大学の中では阪大工学部の受験を目指すということになるかと思います。

逆にイギリスの大学を目指す場合ですが、イギリスの留学でA-levelなどの学位は取得できるのでしょうか。
イギリスでは、高校の卒業資格と、A-levelなどの学位は別物です。ケンブリッジはもちろん、他の主要大学はすべてA-levelなどの学位取得が前提になります。さらに言えば、ケンブリッジでは、そのA-levelでストレートA（日本で言うところのオール5）を取っているような生徒がライバルになります。英語で学び、そのレベルの成績を取るのはなかなか大変だとは思います。しかし、数学科などであれば、ケンブリッジ大学に合格する日本人もいないわけではないので、努力次第です。

最後に日本の高校を卒業して海外を目指す場合ですが、日本の高校卒業資格では、ケンブリッジ大学などのイギリスの大学に直接入学することはできません。ファウンデーションコースなどに1年間通ってから進学する手はありますが、ケンブリッジやオックスフォードなどはそれも無理で、実際にはA-levelを取得することが必要になります。

Update: '18年11月6日
2016年10月にいただいたご質問への回答

単身留学生は帰国枠が使えなくても、単身残留生であれば帰国枠が使えるといったことはあるのですが、単身で残留した期間によっては制限があります。1年未満であればほとんど問題ありませんが、2年を超える残留は、単身留学と同じ扱いになることが多いと考えてよいでしょう。

条件は大学学部によって異なりますので、詳しくは大学の入試要項を確認するか、または直接問い合わせをする必要があります。

証明に関しても同様で、領事館の証明の提出が求められる場合と、会社の証明でよいという場合がありますから、必ず大学に直接問い合わせをするよう心がけてください。

Update: '18年6月5日
2016年3月にいただいたご質問への回答

また、統一試験の結果提出が必要な場合でも、NCEA取得見込みということで受験可能な大学もあります。その場合はNCEAの結果が出た段階で提出することになります。

ただし、慶應義塾大学では、出願の段階で統一試験資格の提出が必要です。したがって、1年遅れて受験するか、もしくはSATなど別の統一試験資格を取得して受験することになります。

南半球の帰国生にとって統一試験資格以上に気をつけるべき点は、受験対策にかけられる期間です。帰国枠大学受験の入試時期が9月から10月に集中するのに、卒業がその年度の冬ということになるため、6月に卒業時期がある欧米からの帰国生に比べると受験対策準備にかけられる時間が圧倒的に違うということになります。

それをカバーするためには、半年前の12月から1月の冬休み（現地では夏休み）に、受験の緊張感を持ちながら、対策をすることが必要になります。もっとも、1年遅らせた受験を想定しているのであれば、受験対策に10ヶ月近い期間がありますから、問題にはなりません。あるいは国際教養系の大学学部や９月入学の学部を受験する場合も、特に不利になることはありません。主に書類選考だからです。

Update: '18年1月26日
2015年6月にいただいたご質問への回答

早稲田大学の商学部や慶応義塾大学の法学部なども一部秋入学を行いますが、ほとんど合格者を出しておらず、実質的には4月入学者が大半です。

また、日本の大学では1月入学というのはないので、秋入学を逃した場合は翌年4月入学を目指すということになります。

秋入学で目的の大学学部に入れるのばベストですが、慌ててミスマッチの学部に行くよりも、日本の大学はまだまだ4月入学が主流ですので、じっくりと考えて4月入学を目指すというのも検討してみてはいかがでしょうか。

Update: '17年10月19日
2015年5月にいただいたご質問への回答

在籍が1年に満たないと学校生活に馴染めないまま卒業となるケースも多いので、学校も受け入れに慎重になると思われます。したがって、高校2年生に編入する方がリスクは低いと言えます。

帰国枠大学受験の観点から見ても、今はAO入試等が広がっているので、高校2年生に編入したからといって、それほど不利になるというわけでもありません。

Update: '17年4月18日
2015年1月にいただいたご質問への回答

提出を問わないということとは意味が違います。したがって、書類選考で落とされると決まってはいませんが、不利に立たされることは間違いないでしょう。

ただし、中国の統一試験の場合、留学生は受験資格が得られないので、統一試験そのものが評価の対象とならずに、HSKなどを代わりとする場合もあります。

Update: '17年3月13日
2014年7月にいただいたご質問への回答